Identificação molecular de Euterpe edulis Mart. (palmito juçara) através da técnica de High Resolution Melting : uma potencial contribuição para a conservação da Mata Atlântica

Oliveira, Karoline Telles de

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dc.contributor.advisor	Salgueiro, Fabiano
dc.contributor.author	Oliveira, Karoline Telles de
dc.date.accessioned	2018-02-21T19:39:46Z
dc.date.available	2018-02-21T19:39:46Z
dc.date.issued	2017-02-20
dc.identifier.citation	OLIVEIRA, Karoline Telles de. Identificação molecular de Euterpe edulis Mart. (palmito juçara) através da técnica de High Resolution Melting: uma potencial contribuição para a conservação da Mata Atlântica. 46 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Estado do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, 2017.	pt_BR
dc.identifier.uri	http://hdl.handle.net/unirio/11017
dc.description	Dissertação também disponível em formato impresso, com o número de chamada CCBS MCB 2017/03.	pt_BR
dc.description.sponsorship	n/a	pt_BR
dc.language.iso	Portuguese	pt_BR
dc.rights	openAccess	pt_BR
dc.title	Identificação molecular de Euterpe edulis Mart. (palmito juçara) através da técnica de High Resolution Melting : uma potencial contribuição para a conservação da Mata Atlântica	pt_BR
dc.type	masterThesis	pt_BR
dc.contributor.referee	Salgueiro, Fabiano
dc.contributor.referee	Silva, Eliane Maria Ribeiro da
dc.contributor.referee	Margis, Rogério
dc.degree.department	CCBS	pt_BR
dc.degree.grantor	Universidade Federal do Estado do Rio de Janeiro - UNIRIO	pt_BR
dc.degree.level	Mestrado Acadêmico	pt_BR
dc.degree.local	Rio de Janeiro, RJ.	pt_BR
dc.degree.program	Programa de Pós-Graduação em Ciências Biológicas	pt_BR
dc.subject.cnpq	CIÊNCIAS BIOLÓGICAS	pt_BR
dc.subject.en	Euterpe edulis	pt_BR
dc.subject.en	Euterpe oleracea	pt_BR
dc.subject.en	Bactris gasipaes	pt_BR
dc.subject.en	cpDNA	pt_BR
dc.subject.en	High Resolution Melting	pt_BR
dc.subject.en	SNPs	pt_BR
dc.description.abstracten	Palm heart is one of the Non-Timber Forest Products (NTFPs) of major socioeconomic importance. It is widely accepted in Brazil and in the world. Three palm species stand out in the production of heart of palm in Brazil: Euterpe edulis Mart, Euterpe oleracea Mart. and Bactris gasipaes Kunth. The Euterpe edulis from it the ‘palmito-juçara’ is extracted it is a threatened of extinction. And is found principally at the Atlantic Forest As opposed to E. oleracea (açaizeiro) and B. gasipaes (pupunha), the E. edulis has a unique stalk, and the extraction of heart of palm provoke, the death of an entire plant. Morphological characters are the main means of information in the identification of plants. The identification of palm trees depends on the interpretation of the reproductive or vegetative material. Thus it is difficult to distinguish the species by examining only the palm heart. This work aims to develop a methodology that identify the fresh palm heart and canned palm hearts from the species E. edulis, E. oleracea and B. gasipaes through the technique of Hight Resolution Melting (HRM). The purpose is to provide a methodology for certification and molecular authentication of fresh palm hearts from each of these three palm species and thus contribute to conservation and operate as a validation tool for the product that reaches the consumer. Initially universal primers were used for the amplification and sequencing eight different loci in the cpDNA from leaf samples of these three palm species, come from different places. The sequences were analyzed in the MEGA 7 program in the search for polymorphisms that allowed the discrimination of the species. Eight loci were tested, in three loci were observed substitutions of different classes of single nucleotide polymorphisms (SNPs). A new pair of primers, specific for one of these polymorphic regions, contains three SNPs, was designed and used in HRM reactions with samples of fresh palm heart, canned palm hearts and leafs. As HRM analyzes were performed in the Bio-Rad Precision Melting Analysis® program. The confidence index with which each sample being assigned to the cluster ranged from 97.7% to 98.9% and the conventional melting temperature (Tm) of the E. edulis and B.gasipaes was 76, 0°C and E. oleracea was 76, 4 °C. In HRM analyzes three clusters were formed, which allowed identify samples from the three palm species, independent of the analyzed tissue. This confirms the sensitivity and robustness of the technique used in this study and its potential use in the authentication of palm hearts.	pt_BR
dc.degree.country	Brasil	pt_BR
dc.description.sponsordocumentnumber	n/a	pt_BR
dc.description.abstractpt	O palmito é um dos Produtos Florestais Não Madeireiros (PFNMs) com maior importância socioeconômica. Possui grande aceitação no Brasil e no mundo. Três espécies de palmeiras se destacam na produção de palmito no Brasil: Euterpe edulis Mart, Euterpe oleracea Mart. e Bactris gasipaes Kunth. A Euterpe edulis é uma palmeira característica da Mata Atlântica ameaçada de extinção. Dela se extrai o palmito juçara. Diferentemente da E. oleracea (açaizeiro) e da B. gasipaes (pupunha), a E. edulis possui estipe único, o que provoca a morte da palmeira quando usada para a extração do palmito. Os caracteres morfológicos são os principais meios de informação na identificação de plantas; e a identificação de palmeiras geralmente depende da interpretação do material vegetativo e reprodutivo. Desta forma, é difícil distinguir as espécies examinando apenas o palmito. Este trabalho tem como objetivo o desenvolvimento de uma metodologia que identifique o palmito proveniente das espécies E. edulis, E. oleracea e B. gasipaes através da técnica de High Resolution Melting (HRM). O propósito é disponibilizar uma metodologia de certificação e autenticação molecular de palmitos in natura e em conserva proveniente de cada uma destas três espécies de palmeiras e assim contribuir para a conservação e atuar como uma ferramenta de validação do produto que chega até o consumidor. Inicialmente primers universais foram usados para amplificar e sequenciar oito diferentes locos de DNA do cloroplasto a partir de amostras foliares destas três espécies de palmeiras, oriundas de diferentes procedências. As sequências foram analisadas no programa MEGA 7 na busca por polimorfismos que permitissem a discriminação das espécies. Dos oito locos testados, em três foram observadas substituições de diferentes classses de Single Nucleotide Polimorphisms (SNPs). Um novo par de primes, específico para uma destas regiões polimórficas, contendo três SNPs, foi desenhado e utilizado nas reações de HRM com amostras de palmito in natura, palmito em conserva e folhas. As análises de HRM foram realizadas no programa Bio-Rad Precision Melting Analysis. O índice de confiabilidade com que cada amostra foi atribuída a um cluster variou de 97,7% a 98,9% e a Temperatura de melting (Tm) convencional de E. edulis e B gasipaes foi de 76ºC e de E. oleracea foi de 76,4ºC. Nas análises por HRM foram formados três clustres, o que permitiu identificar as amostras provenientes das três espécies de palmeiras, independentemente do tecido analisado. Isto demonstra a sensibilidade e robustez da técnica empregada neste estudo e seu potencial uso na autenticação de palmitos.	pt_BR
dc.subject.pt	Euterpe edulis	pt_BR
dc.subject.pt	Euterpe oleracea	pt_BR
dc.subject.pt	Bactris gasipaes	pt_BR
dc.subject.pt	cpDNA	pt_BR
dc.subject.pt	High Resolution Melting	pt_BR
dc.subject.pt	SNPs	pt_BR