Rastreamento molecular de enteropatógenos bacterianos responsáveis por surtos de doenças de transmissão alimentar no Brasil

Santos, André Felipe das Mercês

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Centro de Ciências Biológicas e da Saúde (CCBS)
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dc.contributor.advisor	Rodrigues, Dalia dos Prazeres
dc.contributor.author	Santos, André Felipe das Mercês
dc.date.accessioned	2018-05-24T18:03:57Z
dc.date.available	2018-05-24T18:03:57Z
dc.date.issued	2013
dc.identifier.citation	SANTOS, André Felipe das Mercês. Rastreamento molecular de enteropatógenos bacterianos responsáveis por surtos de doenças de transmissão allimentar no Brasil. 2013. 87 f. Dissertação (Programa de PósGraduação em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Estado do Rio de Janeiro., Rio de Janeiro, 2013.	pt_BR
dc.identifier.uri	http://hdl.handle.net/unirio/11671
dc.description	Dissertação também disponível em formato impresso, com número de chamada CCBS/MGBM/2013/1	pt_BR
dc.description.sponsorship	n/a	pt_BR
dc.language.iso	Portuguese	pt_BR
dc.rights	embargoedAccess	pt_BR
dc.title	Rastreamento molecular de enteropatógenos bacterianos responsáveis por surtos de doenças de transmissão alimentar no Brasil	pt_BR
dc.type	masterThesis	pt_BR
dc.contributor.referee	Rodrigues, Dalia dos Prazeres
dc.contributor.referee	Siciliano, Salvatore
dc.contributor.referee	Guaraldi, Ana Luiza de Mattos
dc.contributor.referee	Nogueira, Eduardo de Matos
dc.degree.department	CCBS	pt_BR
dc.degree.grantor	Universidade Federal do Estado do Rio de Janeiro - UNIRIO	pt_BR
dc.degree.level	Mestrado Acadêmico	pt_BR
dc.degree.local	Rio de Janeiro, RJ	pt_BR
dc.degree.program	Programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular	pt_BR
dc.subject.cnpq	CIÊNCIAS BIOLÓGICAS	pt_BR
dc.subject.cnpq	BIOQUÍMICA	pt_BR
dc.subject.cnpq	BIOLOGIA MOLECULAR	pt_BR
dc.description.abstracten	Bacterial enteropathogens isolated from food-borne outbreaks, received by Central Public Health Laboratories (LACEN), are forwarded to the National Reference Laboratory of Bacterial Enteropathogens (LRNEB) for phenotypic and genotypic characterization. Within the molecular techniques, the subtyping through Pulsed Field Gel Electrophoresis (PFGE) is used as a tool in phylogenetic differentiation between strains from outbreaks with circulating strains. 423 samples were analyzed from 2009 to 2011, however, the most expressive serovars of this group were selected: Salmonella ser. Enteritidis (n = 128), Salmonella ser. Heidelberg (n = 21), Salmonella ser. Newport (n = 16), Salmonella ser. Oranienburg (n = 12), Salmonella ser. Panama (n = 18), Salmonella ser. Schwarzengrund (n = 9), Salmonella ser. Typhi (n = 83) and Salmonella ser. Typhimurium (n = 99), in a total of 386 samples, 350 of which were associated with outbreaks and 36 were not. With respect to the distribution of isolation source, 329 were originated from humans, 51 from food, 5 from environment and 1 from animals. The Southern region presented the greatest percentage of isolation with 42.2%, followed by Northern (27%), Southeast (20%), Midwest (9.5%) and Northeast (1.3%) regions. After PFGE, from the restriction with enzyme Xbal, 10 pulsotypes were obtained for Salmonella ser. Enteritidis, 6 for Salmonella ser. Heidelberg, 10 for Salmonella ser. Newport, 7 for Salmonella ser. Oranienburg, 10 for Salmonella ser. Panama, 3 for Salmonella ser. Schwarzengrund, 17 for Salmonella ser. Typhi and 40 for Salmonella ser. Typhimurium. Despite the high number of samples, Salmonella ser. Enteritidis was the most genomic stable due to the low number of pulsotypes, unlike Salmonella ser. Typhimurium, wich presented the greatest genetic diversity. Salmonella ser. Heidelberg presented a clonal profile distributed in the Southern region and neighboring areas. Two clonal profiles of Salmonella ser. Newport, isolated from an European outbreak occurred in 2011, transmited by Brazilian watermelons, were found in human samples from the states of Minas Gerais and Rio Grande do Sul and in food source of the states of Goiás, Mato Grosso, Mato Grosso do Sul and Bahia. The low number of individual records and low genetic variability of Salmonella ser. Oranienburg confirmed that the outbreak in the state of Maranhão was a one-off. In Espírito Santo in 2010, there was an outbreak of Salmonella ser. Panama and it is believed that the responsible clone was already circulating in our environment, for it was detected in prior periods. Salmonella ser. Schwarzengrund presented a very low number of case studies in Brazil, however, it has a very strong presence in the state of Mato Grosso. During an outbreak of Salmonella ser. Typhi occurred in Amapá it was observed that the responsible clone was endemic in the region, for the same clone in prior periods.	pt_BR
dc.degree.country	Brasil	pt_BR
dc.description.sponsordocumentnumber	n/a	pt_BR
dc.description.abstractpt	Enteropatógenos bacterianos isolados de surtos de origem alimentar, recebidos pelos Laboratórios Centrais de Saúde Pública (LACEN), são encaminhados ao Laboratório de Referência Nacional de Enteropatógenos Bacterianos (LRNEB) para caracterização fenotípica e genotípica. Dentro das técnicas moleculares, a subtipagem através da Eletroforese em Campo Pulsado (PFGE) é utilizada como ferramenta na diferenciação filogenética entre as cepas oriundas de surtos com cepas circulantes. Entre o período de 2009 a 2011, foram analisadas 423 amostras, entretanto, deste grupo selecionou-se os sorovares mais expressivos: Salmonella ser. Enteritidis (n=128), Salmonella ser. Heidelberg (n=21), Salmonella ser. Newport (n=16), Salmonella ser. Oranienburg (n=12), Salmonella ser. Panama (n=18), Salmonella ser. Schwarzengrund (n=9), Salmonella ser. Typhi (n=83) e Salmonella ser. Typhimurium (n=99), contabilizando 386 amostras, sendo 350 ligadas a surtos e 36 não. Com relação a distribuição da fonte de isolamento, 329 foram de origem humana, 51 alimentar, 5 ambiental e 1 animal. A região Sul apresentou o maior percentual de isolamento com 42,2%, seguidos das regiões Norte (27%), Sudeste (20%), Centro-oeste (9,5%) e Nordeste (1,3%). Após a PFGE, a partir da restrição com a enzima Xbal, foram obtidos 10 pulsotipos para Salmonella ser. Enteritidis, 6 para Salmonella ser. Heidelberg, 10 para Salmonella ser. Newport, 7 para Salmonella ser. Oranienburg, 10 para Salmonella ser. Panama, 3 para Salmonella ser. Schwarzengrund, 17 para Salmonella ser. Typhi e 40 para Salmonella ser. Typhimurium. Apesar do alto número amostral, Salmonella ser. Enteritidis foi a mais genomicamente estável pleo baixo número de pulsotipos, ao contrário da Salmonella ser. Typhimurium que apresentou a maior diversidade genética A Salmonella ser. Heidelberg apresentou um perfil clonal distribuído na região Sul e áreas limítrofes. Dois perfis clonais de Salmonella ser. Newport, isolados de um surto europeu ocorrido em 2011, veiculado por melancias brasileiras, foram encontrados em amostras humanas oriundas dos estados de Minas Gerais e Rio Grande do Sul e de fonte alimentar dos estados de Goiás, Mato Grosso, Mato Grosso do Sul e Bahia. O baixo número de registros isolados e a baixa variabilidade genética de Salmonella ser. Oranienburg confirmou que o surto no estado do Maranhão tenha sido um caso pontual. No Espírito Santo em 2010, ocorreu um surto de Salmonella ser. Panama e acredita-se que o clone responsável já circulava em nosso ambiente, pois o mesmo foi detectado em períodos anteriores. A Salmonella ser. Schwarzengrund apresentou uma casuística muito baixa no Brasil, entretanto, a sua presença é bem marcante no estado do Mato Grosso. Durante um surto de Salmonella ser. Typhi ocorrido no Amapá foi observado que o clone responsável era endêmico na região, pois houve notificações do mesmo clone em períodos anteriores.	pt_BR
dc.subject.pt	Salmonella	pt_BR
dc.subject.pt	Subtipificação	pt_BR
dc.subject.pt	Surto	pt_BR
dc.subject.pt	PFGE	pt_BR