Análise de variantes dos genes TBC1D1, MC4R e LEP e estratégias de genotipagem por meio da PCR com iniciadores alelo-específicos

Leal, Roberta Luísa Barbosa

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dc.contributor.advisor	El-Jaick, Kênia Balbi
dc.contributor.author	Leal, Roberta Luísa Barbosa
dc.date.accessioned	2023-03-03T17:07:17Z
dc.date.available	2023-03-03T17:07:17Z
dc.date.issued	2022-08-26
dc.identifier.citation	LEAL, Roberta Luísa Barbosa. Análise de variantes dos genes TBC1D1, MC4R e LEP e estratégias de genotipagem por meio da PCR com iniciadores alelo-específicos. 2022. 115 f. Dissertação (Programa de Pós-Graduação em Biologia Molecular e Celular) - Universidade Federal do Estado do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, 2022.	pt_BR
dc.identifier.uri	http://hdl.handle.net/unirio/13624
dc.description	O texto completo do trabalho está embargado por solicitação do autor ou este não autorizou sua inclusão na Biblioteca Digital da UNIRIO.	pt_BR
dc.description.sponsorship	CAPES	pt_BR
dc.language.iso	Portuguese	pt_BR
dc.rights	restrictedAccess	pt_BR
dc.title	Análise de variantes dos genes TBC1D1, MC4R e LEP e estratégias de genotipagem por meio da PCR com iniciadores alelo-específicos	pt_BR
dc.title.alternative	Analysis of variants of TBC1D1, MC4R and LEP Genes and genotyping strategies through PCR with allele-specific oligonucleotides	pt_BR
dc.type	masterThesis	pt_BR
dc.contributor.referee	El-Jaick, Kênia Balbi
dc.contributor.referee	Oliveira, Carlos Fernando Araujo Lima de
dc.contributor.referee	Albuquerque, Cassiano Felippe Gonçalves de
dc.contributor.referee	Trindade, Pablo
dc.contributor.referee	Amorim, Márcia Rodrigues
dc.contributor.referee	Lima, Marcelo Aguiar Costa
dc.degree.department	CCBS	pt_BR
dc.degree.grantor	Universidade Federal do Estado do Rio de Janeiro - UNIRIO	pt_BR
dc.degree.level	Mestrado Acadêmico	pt_BR
dc.degree.local	Rio de Janeiro, RJ	pt_BR
dc.degree.program	Programa de Pós-Graduação em Biologia Molecular e Celular	pt_BR
dc.subject.cnpq	CIÊNCIAS BIOLÓGICAS	pt_BR
dc.subject.cnpq	BIOQUÍMICA	pt_BR
dc.subject.cnpq	BIOLOGIA MOLECULAR	pt_BR
dc.subject.en	Nutrigenetics	pt_BR
dc.subject.en	Obesity	pt_BR
dc.subject.en	Polymorphisms	pt_BR
dc.subject.en	TBC1D1	pt_BR
dc.subject.en	LEP	pt_BR
dc.subject.en	MC4R	pt_BR
dc.description.abstracten	The identification of genes involved in the predisposition to common obesity still represents a great challenge, mainly due to the genetic complexity of this pathology, resulting in the need for many studies to understand the influence of different variants on the development of obesity. Therefore, this study aims to analyze variants of two genes known to be associated with food intake control and energy homeostasis (LEP and MC4R), and to analyze TBC1D1 variants, considering their important role in glucose metabolism and adipogenesis. Due to the scarcity of data in the literature on the effects of human TBC1D1 variants on the obesity phenotype, the first proposal of the study was to carry out a systematic review on the topic, in order to seek more information about these potential markers and contribute to advances. of research on this gene. A second objective of the study was to analyze the impact of LEP, MC4R and TBC1D1 gene variants on the development of obesity, from the records of 70 individuals, using genotyping results, anthropometric measurements, demographic data and data obtained from a questionnaire. In addition to this, frequency analyzes of the variants and analysis of prediction of the effect of mutations in silico were also performed in order to select variants with greater predictive potential for weight gain, with the proposal to expand the studies from the elaboration of tests of cost-effective genotyping, alternatives to DNA sequencing and real-time PCR. The study of TBC1D1 revealed that some variants had a clinical pathogenic effect, such as obesity, diabetes and/or cachexia. The results of genetic tests designed to detect LEP and TBC1D1 variants were able to identify the genotypes of individuals with high specificity and sensitivity. In summary, the results of the research on the role of TBC1D1 in the development of obesity underscore the need for further studies on this gene, given the complex participation of the TBC1D1 protein in different signaling pathways (not all of which are well understood), and of its interaction with several other proteins, through its different domains. However, the lack of lower cost techniques, alternatives to real time PCR and sequencing, to carry out genotyping studies, still represents a relevant obstacle for the development of these researches in many countries, including Brazil. For this reason, the genotyping tests successfully developed using PCR-ASO suggest that they can significantly contribute to the advancement of research aimed at controlling and preventing obesity in the Brazilian population.	pt_BR
dc.degree.country	Brasil	pt_BR
dc.description.sponsordocumentnumber	n/a	pt_BR
dc.description.abstractpt	A identificação de genes envolvidos na pré-disposição à obesidade comum ainda representa um grande desafio, principalmente devido à complexidade genética desta patologia, resultando na necessidade muitos estudos para a compreensão da influência das diversas variantes para o desenvolvimento da obesidade. Portanto, este estudo tem o objetivo de analisar variantes de dois genes reconhecidamente associados ao controle da ingestão alimentar e à homeostase energética (LEP e MC4R), e de analisar variantes de TBC1D1, considerando seu importante papel no metabolismo da glicose e na adipogênese. Devido à escassez de dados da literatura sobre os efeitos das variantes de TBC1D1 humana para o fenótipo de obesidade, a primeira proposta do estudo foi realizar uma revisão sistemática sobre o tema, a fim de buscar maiores informações sobre estes potenciais marcadores e contribuir para os avanços das pesquisas acerca deste gene. Um segundo objetivo do estudo foi a análise do impacto de variantes dos genes LEP, MC4R e TBC1D1 para o desenvolvimento da obesidade, a partir dos registros de 70 indivíduos, utilizando resultados de genotipagem, medidas antropométricas, dados demográficos e dados obtidos de um questionário. Além desta, análises de frequência das variantes e análises de predição do efeito das mutações in sílico também foram realizadas a fim de selecionar variantes com maior potencial preditivo para o ganho de peso, com a proposta de ampliação dos estudos a partir da elaboração de testes de genotipagem de menor custo, alternativos ao sequenciamento do DNA e ao PCR em tempo real. O estudo de TBC1D1 revelou que algumas variantes apresentaram efeito patogênico clínico, tais com obesidade, diabetes e/ou caquexia. Os resultados dos testes genéticos elaborados para a detecção de variantes de LEP e TBC1D1, foram capazes de identificar os genótipos dos indivíduos com alta especificidade e sensibilidade. Em resumo, os resultados da pesquisa sobre o papel de TBC1D1 para o desenvolvimento da obesidade ressalta a necessidade de mais estudos acerca deste gene, tendo em vista a complexa participação da proteína TBC1D1 em diferentes vias de sinalização (nem todas ainda bem compreendidas), e da sua interação com diversas outras proteínas, por meio dos seus distintos domínios. Todavia, a falta de técnicas de custo mais baixo, alternativas ao PCR em tempo real e ao sequenciamento, para a realização dos estudos de genotipagem, ainda representa um obstáculo relevante para o desenvolvimento destas pesquisas em muitos países, incluindo o Brasil. Por este motivo, os testes de genotipagem elaborados com sucesso por meio da PCR-ASO sugerem poder contribuir de forma expressiva para o avanço das pesquisas que visam o controle e a prevenção da obesidade na população brasileira.	pt_BR
dc.subject.pt	Nutrigenética	pt_BR
dc.subject.pt	Obesidade	pt_BR
dc.subject.pt	Polimorfismos	pt_BR
dc.subject.pt	TBC1D1	pt_BR
dc.subject.pt	LEP	pt_BR
dc.subject.pt	MC4R	pt_BR
dc.subject.decs	Nutrigenômica	pt_BR
dc.subject.decs	Obesidade	pt_BR
dc.subject.decs	Receptor Tipo 4 de Melanocortina	pt_BR